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园艺论文_滇牡丹DFR基因克隆及生物信息学特征
文章摘要:二氢黄酮醇4-还原酶(dihydroflavonol 4-reductase, DFR)是类黄酮代谢途径花青素生物合成后期的关键酶。本研究以滇牡丹不同颜色花瓣和花药为组织材料,通过RT-PCR克隆获得了1个二氢黄酮醇4-还原酶基因PdDFR2。该基因cDNA全长为1 070 bp,开放阅读框为996 bp,编码332个氨基酸。对该基因进行生物信息学分析:相对分子质量为37.39 kD,等电点为5.90,含44个带负电荷的残基(Asp+Glu),37个带正电荷的残基(Arg+Lys),平均疏水性为-0.178,脂肪系数为82.80,分子式为C1681H2625N431O492S20,半衰期为30 h,不稳定指数为40.37,属于不稳定蛋白质。PdDFR2蛋白表现亲水,为非分泌蛋白且不具有信号肽识别功能,没有蛋白跨膜区,为非跨膜蛋白。高级结构预测表明PdDFR2蛋白由4种二级结构组成,其中无规则卷曲占46.39%,是PdDFR2蛋白最主要的二级结构。同时,亚细胞定位预测分析发现PdDFR2蛋白位于细胞质的分值为8.3。系统发育分析表明,PdDFR2与黄牡丹ALX35997.1、牡丹AMW36065.1和芍药AFI71899.1的序列相似度较高,显示较近亲缘关系,且与黄牡丹ALX35997.1亲缘关系最近。本研究结果为滇牡丹不同颜色花瓣花青素生物合成DFR基因家族的研究提供基础数据和科学依据。
文章关键词:
项目基金:文章来源:《牡丹》 网址: http://www.mdzzs.cn/qikandaodu/2021/1112/2239.html
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